Pas de souci, l'électricité si on ne connait pas c'est pas toujours évident... D'ailleurs même quand on connaît un peu, mais qu'on lit mal les schémas fournis, ben on se gourre : effectivement je ne vois pas non plus pourquoi tu aurais 12v en sortie du fgs...
Je ne connais pas ce module, et en plus j'avais mal regardé : il semble bien qu'il soit en contact sec et il ne serait donc pas à l'origine du souci, désolé pour l'erreur d'aiguillage !
Ceci dit, même si il ne doit y avoir qu'un seul contact sec connecté à la platine, je ne vois pas pourquoi un second poserait souci : un contact sec n'est qu'un interrupteur entre 5 et 6 donc tu pourrais en mettre 10 que ça ne devrait pas poser souci...

(Pour le non alimenté c'est juste qu'il faut que ce soit bien un contact sec, c'est à dire qu'aucune tension ne doit être reliée aux bornes 5-6)
Pour tester l'origine du souci je ferais 2 essais :
- fgs débranché, un bout de fil dénudé des deux côtés et tu touches 5-6 : si ton portail s'active sans erreur alors le pb vient du fgs
- si même problème, un essai en enlevant le portier vidéo mais avec le fgs, tu touches encore 5-6 : si ça fonctionne alors le portier est en cause et ne supporterait pas un autre contact sec (ça serait très surprenant électriquement parlant...)
Pour le second capteur, c'est dommage effectivement parce qu'il te manquera une info pour être sûr de la position du portail.
Encore une fois difficile sans être devant, mais peut-être que si tu mets un capteur à gauche (en imaginant que tu es au-dessus de la crémaillère) l'aimant venant en face quand le portail est fermé et un autre capteur à droite, au pire un peu décalé avec l'aimant à l'autre bout de la crémaillère, en face quand le portail est ouvert ? (Je ne sais pas si je suis très clair là...

)
Si tu as un multimètre, tu peux aussi tester la tension entre in et q lors de l'activation : elle doit toujours être nulle.
Et tu peux alors aussi en profiter pour mesurer la tension entre 7 et 9 : tu dois avoir 24v continu environ (ce qui te permettrait d'alimenter le fgbs et ainsi de simplifier grandement ton installation... J'insiste mais plus le système est simple plus il sera fiable et facile à maintenir par la suite

).
Si tu n'en n'as pas, vu que tu as l'air de bricoler quand même un peu l'investissement sera vite rentabilisé (quelques euros pour un modèle de base, chez action par exemple...).
Ah et en regardant tes photos, revérifie bien tes câblages : il semble que le IN du fgs ne soit pas connecté... (Pourrait être une source de problème)